如果血浆病原DNA提取试剂盒中提取的DNA溶液OD260/OD280比值小于1.6,通常说明有蛋白质或酚、多糖等的污染;如果提取的DNA溶液OD260/OD280>1.9,则表明有RNA污染。
在选择DNA提取试剂盒时,较重要的变量可能是你所使用的生物体。
1、许多试剂盒都有用于DNA分离的不同成分,这些试剂盒之间的主要区别在于细胞是如何被分解的,因为有些比其他更更有挑战性。例如,形成生物膜的可能比传统的基于去垢剂的方法需要更强的裂解技术。
2、动物组织:用于动物组织DNA分离的试剂盒通常具有更温和的裂解技术,因为大多数动物细胞不像细胞那样有细胞壁。然而,动物组织DNA提取的挑战往往在于选择合适的组织匀浆方法。此外,许多动物DNA纯化试剂盒不使用/氯仿萃取或乙醇作为沉淀步骤,以减少破坏DNA的风险。
3、植物:当涉及到植物DNA分离时,必须考虑到其他一些因素,需要注意污染物的去除。植物在纯化过程中通常含有未分离的糖,因此,洗涤剂选择性地与DNA结合并从溶液中析出,通常是先将洗涤剂溶解在高浓度的盐溶液中,然后提取DNA。
4、血液:由于技术上的许多新进展,血液DNA分离试剂盒中有多种裂解技术和提取方法可供选择。从血液中分离出的DNA将在很大程度上决定你使用的裂解和提取的类型。无论应用是什么,一定要选择一种能够提供纯净、完整、双链和浓缩DNA的试剂盒,以获得较好地效果。
血浆病原DNA提取试剂盒采用特别的裂解液配方,可直接从新鲜、冷冻或陈旧的全血中提取高质量的基因组DNA,也可以直接提取得到血液中感染的细胞DNA, 省去了一般血液DNA提取试剂盒所需的白细胞分离步骤,操作简便快速,只需几十分钟左右即可完成血液DNA提取,并且DNA提取得率较高,可在200 μl 全血中提取2-5ug左右基因组DNA。血浆病原DNA提取试剂盒采用了较新的优良离子膜、裂解液和洗脱液,经过多次优化,提取得到的DNA纯度更高,较大限度地去除了蛋白、色素、脂类等杂质污染,可以直接应用于PCR、荧光定量PCR和各种酶切试验等。
不同的DNA来源有不同的试剂盒,从实验室培养的细胞,到土壤样本,甚至指纹,也有许多用于某些应用的试剂盒。例如,土壤中的腐殖酸或血液中的血红蛋白会污染纯化的DNA,从而干扰下游的DNA实验(如PCR)。当然,也有一些试剂盒会在进行纯化步骤之前去除这些组分。如果想从PCR或琼脂糖凝胶中纯化DNA,有许多方法可以提高琼脂糖凝胶纯化的回收率。
血浆病原DNA提取试剂盒使用注意事项:
1、裂解液、洗涤液含有一定性化学物质,操作过程请做好防护措施,避免直接接触皮肤,防止吸入鼻和口中。如不慎沾染皮肤或眼睛,请立即用清水或生理盐水冲洗,必要时请就医。
2、如血液量不足200μL,请用0.85% 生理盐水补至200μL;如血液量**出200μL,请使用中量血液DNA提取试剂盒或血液富集DNA提取试剂盒。
3、如果提取的血液为鸟类、禽类的血液,因有核红细胞较多,提取血液量应适当减少,研究者应该进行优化实验,选择合适用量。
4、提取的DNA如暂不使用,应-20℃保存。
实验室工作中,经常会需要用到纯化的DNA,这时我们通常需要使用一个商业的DNA提取试剂盒对目的DNA进行分离纯化。市面上有很多类型的提取试剂盒,当使用不太熟悉的样本类型时,选择合适的盒子是尤为关键的。
目前大多数DNA提取试剂盒遵循相同的基本步骤:裂解、柱纯化、洗涤杂质、柱洗脱。然而,不同的盒子在完成每个步骤的方式上有很大的不同。
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