高通量测序(NGS)应用科普
高通量测序技术在**基因检测中应用广泛。一方面通过基因测序可以找出癌症的突变基因,从而迅速确定对症药物;另一方面,样本类型可以是患者的血液甚至唾液,*传统的病理切片,减少诊断过程中对患者机体的损伤。下面我们来简单介绍NGS在**样本基因检测应用中的流程。
1、样本接收与质量控制
血浆样本要求:
用于ctDNA检测的血液采集量必须在8ml以上,使用专业的BunnyTubeTM游离DNA样本保存管室温保存运输到中心实验室。
**石蜡样本(FFPE)要求:
①整个福尔马林固化石蜡包埋组织蜡块;②组织大小>0.5*0.5cm,切出5-10张未染色处理过的石蜡组织,厚度2-5μm;③组织大小<0.5*0.5cm,需10-15张,制成切片或直接保存到1.5mlEP管内**细胞含量不低于10%,坏死组织不大于70% 。玻片盒上要标明姓名、出生日期和采集日期,常温保存即可。
2、样本DNA提取与破碎
针对不同样本类型运用不同提取试剂盒,提取所需DNA,并通过超声波破碎方法,使大分子片段的DNA行成一定长度范围内的短序列片段。
3、文库构建与富集
文库构建:将提前准备好的接头添加到提取到的DNA片段中,然后通过DNA分选与纯化试剂盒,去除不符合要求的大、小DNA片段以及多余的接头及其他杂质。
文库富集:通过加入阻断寡核苷酸--分子杂交(加入探针与目标杂交捕获)--吸附探针(加入磁珠从而吸附探针)--磁沉降(用磁铁捕获目标片段,洗脱掉off-target片段),实现目标DNA片段的选择。
4、高通量测序
5、生信分析与报告生成
样本数据下机后,计算中心根据不同实验项目的要求,对数据使用不同的分析,计算方法进行分析。再根据生信信息分析的结果生成一份具体的报告,以便医生解读。
兔牙生物科技产品专为NGS开发设计,广泛应用于**基因检测,产前筛查及宏基因组测序。
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