如果血浆病原DNA提取试剂盒中提取的DNA溶液OD260/OD280比值小于1.6,通常说明有蛋白质或酚、多糖等的污染;如果提取的DNA溶液OD260/OD280>1.9,则表明有RNA污染。
血液游离DNA(又称血液循环DNA)是指血液中游离于细胞外的DNA,其来源主要有三:白细胞崩解释放的DNA、坏死组织特别是肿 瘤组织释放入血液的DNA和感染病毒等的DNA。近几年来,随着基因诊断技术的发展,游离核酸的应用价值越来越大,如优生筛查、早期诊断、遗传病检测和病原体感染基因检测等。但血液中游离DNA含量一般较低,片段较小,不易提取,这大大影响了游离核酸的基因检测和各种研究的开展。
血浆病原DNA提取试剂盒的操作步骤:
1、取出洗涤液,按以下操作:
洗涤液A:21mL加入9mL无水乙醇;42mL加入18mL无水乙醇,混匀。
洗涤液B:9mL加入21mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇,混匀。
配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
2、取1.5mL离心管,加入200μL血液样本,再加入200μL 裂解液及40μL 消化液,振荡混匀,65℃水浴10 分钟。
3、加入150μL异丙醇(总体积的25%),混合均匀,如有半透明悬浮物,不影响DNA的提取与后续实验。
4、将吸附柱放入收集管内,将上述溶液转入吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液;
5、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
6、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
7、按每份样本40μL 取洗脱液,放置于灭菌1.5mL离心管,65℃预热。
8、将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 离心2 分钟,离去残留的洗涤液。
9、取出吸附柱,放入新的1.5 mL 灭菌离心管内,在吸附柱中心加入40 μL 预热洗脱液,静置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟,收集DNA溶液。提取的DNA即可用于下一步实验或-20℃保存。
在选择DNA提取试剂盒时,较重要的变量可能是你所使用的生物体。
1、许多试剂盒都有用于DNA分离的不同成分,这些试剂盒之间的主要区别在于细胞是如何被分解的,因为有些比其他更更有挑战性。例如,形成生物膜的可能比传统的基于去垢剂的方法需要更强的裂解技术。
2、动物组织:用于动物组织DNA分离的试剂盒通常具有更温和的裂解技术,因为大多数动物细胞不像细胞那样有细胞壁。然而,动物组织DNA提取的挑战往往在于选择合适的组织匀浆方法。此外,许多动物DNA纯化试剂盒不使用/氯仿萃取或乙醇作为沉淀步骤,以减少破坏DNA的风险。
3、植物:当涉及到植物DNA分离时,必须考虑到其他一些因素,需要注意污染物的去除。植物在纯化过程中通常含有未分离的糖,因此,洗涤剂选择性地与DNA结合并从溶液中析出,通常是先将洗涤剂溶解在高浓度的盐溶液中,然后提取DNA。
4、血液:由于技术上的许多新进展,血液DNA分离试剂盒中有多种裂解技术和提取方法可供选择。从血液中分离出的DNA将在很大程度上决定你使用的裂解和提取的类型。无论应用是什么,一定要选择一种能够提供纯净、完整、双链和浓缩DNA的试剂盒,以获得较好地效果。
血浆病原DNA提取试剂盒的优势:
1、从血液样本中分离基因组DNA,线粒体DNA,病毒DNA等;
2、样本制备时间少;
3、纯化的DNA具有优异的质量和产量,并且可应用于很多下游应用,包括PCR、qPCR、测序、基因分型、病毒检测、Southern印迹分析。
血浆病原DNA提取试剂盒使用注意事项:
1、裂解液、洗涤液含有一定性化学物质,操作过程请做好防护措施,避免直接接触皮肤,防止吸入鼻和口中。如不慎沾染皮肤或眼睛,请立即用清水或生理盐水冲洗,必要时请就医。
2、如血液量不足200μL,请用0.85% 生理盐水补至200μL;如血液量**出200μL,请使用中量血液DNA提取试剂盒或血液富集DNA提取试剂盒。
3、如果提取的血液为鸟类、禽类的血液,因有核红细胞较多,提取血液量应适当减少,研究者应该进行优化实验,选择合适用量。
4、提取的DNA如暂不使用,应-20℃保存。
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