如果血浆病原DNA提取试剂盒中提取的DNA溶液OD260/OD280比值小于1.6,通常说明有蛋白质或酚、多糖等的污染;如果提取的DNA溶液OD260/OD280>1.9,则表明有RNA污染。
实验室工作中,经常会需要用到纯化的DNA,这时我们通常需要使用一个商业的DNA提取试剂盒对目的DNA进行分离纯化。市面上有很多类型的提取试剂盒,当使用不太熟悉的样本类型时,选择合适的盒子是尤为关键的。
目前大多数DNA提取试剂盒遵循相同的基本步骤:裂解、柱纯化、洗涤杂质、柱洗脱。然而,不同的盒子在完成每个步骤的方式上有很大的不同。
一般来说,质粒DNA分离要比基因组DNA分离温和。这是因为针对质粒DNA的裂解步骤需要染色体DNA与细胞蛋白片段保持结合,以防止其污染终的样品。两种类型的DNA回收都有试剂盒,甚至有可以同时纯化基因组DNA和总RNA的试剂盒。
当使用血浆病原DNA提取试剂盒分离不同血液体积样本时,能表现得更好,在于提取更高的DNA产量和纯度。
血浆病原DNA提取试剂盒采用特别的裂解液配方,可直接从新鲜、冷冻或陈旧的全血中提取高质量的基因组DNA,也可以直接提取得到血液中感染的细胞DNA, 省去了一般血液DNA提取试剂盒所需的白细胞分离步骤,操作简便快速,只需几十分钟左右即可完成血液DNA提取,并且DNA提取得率较高,可在200 μl 全血中提取2-5ug左右基因组DNA。血浆病原DNA提取试剂盒采用了较新的优良离子膜、裂解液和洗脱液,经过多次优化,提取得到的DNA纯度更高,较大限度地去除了蛋白、色素、脂类等杂质污染,可以直接应用于PCR、荧光定量PCR和各种酶切试验等。
血浆病原DNA提取试剂盒的操作步骤:
1、取出洗涤液,按以下操作:
洗涤液A:21mL加入9mL无水乙醇;42mL加入18mL无水乙醇,混匀。
洗涤液B:9mL加入21mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇,混匀。
配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
2、取1.5mL离心管,加入200μL血液样本,再加入200μL 裂解液及40μL 消化液,振荡混匀,65℃水浴10 分钟。
3、加入150μL异丙醇(总体积的25%),混合均匀,如有半透明悬浮物,不影响DNA的提取与后续实验。
4、将吸附柱放入收集管内,将上述溶液转入吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液;
5、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
6、将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B至吸附柱内,12,000 rpm 离心1 分钟,弃收集管内废液。
7、按每份样本40μL 取洗脱液,放置于灭菌1.5mL离心管,65℃预热。
8、将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 离心2 分钟,离去残留的洗涤液。
9、取出吸附柱,放入新的1.5 mL 灭菌离心管内,在吸附柱中心加入40 μL 预热洗脱液,静置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟,收集DNA溶液。提取的DNA即可用于下一步实验或-20℃保存。
游离DNA提取方法一般有TRizol方法、离心柱法、磁珠法。其中,Trizol方法与离心柱相比,提取效果相当,但是因其对操作者带来的毒性,现在越来越被弃用。磁珠法比较适合机器自动化提取,如果没有核酸提取仪,只是使用磁力架配套提取,磁珠法的操作就比较麻烦且容易导致样本交叉污染。另外,根据研究,磁珠法的核酸提取得率不如离心柱法。如果要提取的游离核酸的量比较低,选择离心柱法。对于游离DNA含量较低的样本或比较珍贵的样本或样本总数不是很多的实验室,核酸提取方法应是离心柱法。
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