FFPE样本DNA提取试剂盒无有害试剂,提高实验的安全性;自动化提取满足不同通量需求,显著提高生产率;更大程度减少手工操作时间。
FFPE样本DNA提取试剂盒的常见问题分析及解决方法:
从前处理、提取、建库到测序分析,FFPE样本常见问题复杂多样,其中绝大部分问题和样本直接相关,可以通过回溯实验过程及分析来优化实验。
1、文库复杂度低
原因:样本质量差:测序深度太高;
优化方法:规范前处理、核酸提取过程;检查设备状态等;调整测序深度。
2、文库片段短
原因:样本质量差;打断时间过长
优化方法:规范前处理;调整打断时间。
3、文库总量低
原因:核酸投入/杂交投入量低;样本质量差;实验操作不规范;
优化方法:投入足够量的核酸,规范实验操作。
FFPE样本DNA提取试剂盒为福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样品中的总RNA和基因组DNA的连续分离和纯化提供了一种快速方法。使用该试剂盒将RNA和DNA依次纯化成单的组分。能够纯化大部分的RNA,从大的mRNA和核糖体RNA到microRNA和小干扰RNA,取决于FFPE组织的年限,因为RNA的片段化程度将随着时间增加。在不使用或氯仿的情况下从其他细胞组分中纯化RNA。纯化的RNA具有较高的完整性,可用于许多下游应用,包括实时PCR,逆转录PCR,RNA印迹,RNA酶保护和引物延伸,以及表达谱测定。纯化的基因组DNA也具有较高质量,可用于PCR反应,测序,Southern印迹和SNP分析。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品优势:
1、高纯:提取基因组DNA产量高、纯度好,蛋白和RNA污染低;
2、兼容:适用于各种不同FFPE组织样本及低质量样本的提取;
3、安全:操作简单,无酚、氯仿等溶剂;
4、自动化:兼容手动提取及自动化提取程序。
福尔马林固定石蜡包埋( Formalin Fixed andParaffin Embedde, FFPE)成为病理学、法医病理学等进行样本保存的主要手段。对组织样本进行FFPE的保存,有助于研究人员更加深入地了解经多年保存后的病理标本中所包含的遗传机制和病理成因。目前,**约有2-4亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究宝贵的的生物学资源之一。
FFPE样本DNA提取试剂盒的产品特点:
1、基于纳米磁珠的提取纯化技术;
2、高载量,高提取效率;
3、适合手工提取及自动化工作站使用; 操作便捷;
4、提取产物可用于PCR、实时荧光定量PCR、二代测序等。
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